Všechny připomínky podané ve veřejném projednání budou vyhodnoceny a výsledky budou zaneseny do nové podoby Plánu. Tento proces je v kompetenci pořizovatele, tedy Odboru územního rozvoje Magistrátu hl. m. Prahy. Na vypořádávání také spolupracuje určený zastupitel jakožto zástupce samosprávy a Institut plánování a rozvoje hl. m. Prahy z pozice zpracovatele.

Je potřeba myslet na to, že ne všechny připomínky mohou být vypořádány souhlasně. Vždy je nadřazen veřejný zájem, který byl již ve fázi společného jednání domluven s dotčenými orgány. Vypořádávání také ctí celkovou koncepci Metropolitního plánu a kontinuitu územního plánování.

Po vypořádání všech připomínek budou výsledky zapracovány do Metropolitního plánu. Poté mohou nastat dvě varianty, pokud nedojde k podstatným úpravám návrhu, bude tento předložen Radě hl. m. Prahy a Zastupitelstvu hl. m. Prahy ke schválení. Pokud by byl však návrh výrazně měněn, bude se opakovat veřejné projednání a občané dostanou opět možnost se k návrhu vyjádřit, avšak pouze k jeho změněným částem.