Na vodních tocích Vltavě a Berounce je vymezeno záplavové území nejvyšší zaznamenané přirozené povodně (srpen 2002) a aktivní zóna pro průtoky s periodicitou 100 let. Na drobných vodních tocích jsou vodoprávním úřadem stanovena záplavová území pro průtoky, které se vyskytují při přirozené povodni s periodicitou 100 let.
Záplavová území stanovuje příslušný vodoprávní úřad (Odbor ochrany prostředí Magistrátu hl. m. Prahy) formou opatření obecné povahy. V Praze jsou záplavová území následně zpravidla implementována do platného Územního plánu sídelního útvaru hl. m. Prahy (procesem jeho změny). Vodní toky, plochy a záplavová území jsou vymezena ve výkresech č. 4 a 9, kategorie záplavových území ve výkresu č. 33. V textové části územního plánu je záplavovým územím věnován oddíl 9. Kompletní úplné znění platného územního plánu najdete na webu pořizovatele, jeho grafickou část pak také v mapové aplikaci Výkresy ÚP. Informace o vodstvu, zátopových oblastech, rozlivech N-letých povodní v Praze apod. lze nalézt v mapové aplikaci Záplavová území.
Platný územním dále vymezuje tzv. nerozvojová území, která do něj byla implementována v reakci na povodně v roce 2002. V nerozvojovým územím území je možné pouze zachování stávajících staveb bez možnosti další stavební činnosti. Nerozvojová území jsou jedním z regulativů prostorového uspořádání území (oddíl 7 textové části územního plánu). Nerozvojová území jsou vyznačena překryvným značením ve výkresu č. 4.